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Chip-atlas数据库

http://gtrd20-06.biouml.org/ WebMar 28, 2024 · 为了弥补这个不足，研究人员开发了基因转录调控数据库：GTRD。. GTRD从SRA、GEO、ENCODE等公共数据库中收集转录因子相关的ChIP-seq数据，采用标准流程进行peak calling分析，并基于已有的 …

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Webchip项目组按照东、中、西分层，根据系统抽样方法抽取得到chip样本。 样本覆盖了从15个省份126城市234个县区抽选出的18948个住户样本和64777个个体样本，其中包括7175户城镇住户样本、11013户农村住户样本和760户外来务工住户样本。 Webenhancer的基本概念：. 长度几十到几千bp，作用是提高靶基因活性，属于顺式作用原件，DNA作用到DNA，转录因子就是反式，是结合到DNA的蛋白。. 1981年，Benerji发 … floral brown paper https://eurekaferramenta.com

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WebOct 4, 2024 · ChIP-Atlas. An integrative, comprehensive database to explore public Epigenetic dataset, including ChIP-Seq, DNase-Seq, ATAC-Seq, and Bisulfite-Seq data: ChIP-Atlas covers almost all public data … Web对于TCGA (The Cancer Genome Atlas)这个在生信研究中大佬级别的存在，想必大家伙儿都已经耳熟能详了吧？. 前不久我们一本八道老师对TCGA家族的好兄弟TCIA (The Cancer Immunome Atlas)做了详细介绍，大快朵颐之后，不少小伙伴不禁感慨意犹未尽。. 那么在今天，就来说说TCGA ... Web如果有更多人需要chip数据，请直接在chip项目有关平台申请。 （3）本数据使用制度的最终解释权归属于“北京师范大学中国收入分配研究院”。 （4）如果您使用CHIP数据有一些研究成果，希望您能告诉我们，以便于我们整理CHIP数据的使用情况。 greatscapes and more

【工具】用Chip-Atlas查找基因的转录因子 - 知乎

Category:ChIP-Atlas:基于公共chip_seq数据进行分析挖掘 - 51CTO

Tags:Chip-atlas数据库

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Pathology atlas - The Human Protein Atlas

http://www.bio-info-trainee.com/4538.html WebFANTOM5 miRNA atlas. The FANTOM5 integrated miRNA expression atlas shows the expression patterns of miRNAs profiled by sequencing short RNA libraries obtained from human, mouse, rat dog and chicken samples. Both the sRNA expression profile of the mature miRNA and the CAGE expression profile of its associated promoter can be …

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WebRelease version 2.2.0 (2016-07-21) Updated gene annotation sets of human and mouse. Human: GENCODE v25 Mouse: GENCODE M10 Release version 2.1.0 (2016-06-01) …

WebENCODE. Functional genomics. Functional characterization. Encyclopedia of elements. Rush Alzheimer’s. EN-TEx. Deeply profiled cell lines. Protein knockdown (Degron) Computational and integrative products. WebDec 18, 2024 · ChIP-Atlas收集整理了SRA数据库中的大量chip_seq数据，并基于这些原始数据进行了后续分析，将分析结果整理成在线服务并发布，方便检索与查询，网址如下. …

WebJun 30, 2024 · 2.点击Tissue，进入组织图谱(Tissue Atlas) 进入该板块后，首先便是TP53基因的基本信息介绍，包括名称，蛋白分类，蛋白的定位等信息。 随后，数据库展示 … WebJun 21, 2024 · 欢迎关注”生信修炼手册”! ChIP-Atlas收集整理了SRA数据库中的大量chip_seq数据，并基于这些原始数据进行了后续分析，将分析结果整理成在线服务并发 …

Webchip 调查与 nbs 住户调查十分类似。 li 等学者（ 2008 ）曾探讨过 nbs 住户调查样本是如何选择的。其他有关 nbs 调查的细节可详见最新的 nbs 统计报告和相关出版物。 所有的 …

WebThe Cancer Genome Atlas (TCGA), a landmark cancer genomics program, molecularly characterized over 20,000 primary cancer and matched normal samples spanning 33 cancer types. This joint effort between NCI and the National Human Genome Research Institute began in 2006, bringing together researchers from diverse disciplines and multiple … greatscapes richmond vaWebApr 18, 2024 · 芯片图集 是一个数据库，它收集根据ChIP-Seq和DNase-Seq数据计算出的床文件，这些数据已存储在Sequence Read Archive（SRA）中。该数据库具有Web界面，可从计算出的峰调用数据 … floral bucket hats with stringWebGene Expression Omnibus. GEO is a public functional genomics data repository supporting MIAME-compliant data submissions. Array- and sequence-based data are accepted. … floral bull skull wall decorWebApr 10, 2024 · atlas 是apache下的大数据的元数据管理和数据治理平台，是Hadoop社区为解决Hadoop生态系统的元数据治理问题而产生的开源项目，它为Hadoop集群提供了包括数据分类、集中策略引擎、数据血缘、安全和生命周期管理在内的元数据治理核心能力。 greatscapes winchester vahttp://chip-atlas.org/ floral bubble swim capWebChIP-Atlas is able to show alignment and peak-call results for all public ChIP-seq and DNase-seq data archived in the NCBI Sequence Read Archive (SRA), which … floral bull wall decorWebNov 23, 2024 · ChIP-Atlas收集整理了SRA数据库中的大量chip_seq数据，并基于这些原始数据进行了后续分析，将分析结果整理成在线服务并发布，方便检索与查询/ 构建的流程如下. 下载SRA原始数据，采用sratoolkit转换成fastq, 然后用bowtie2比对参考基因组，用macs2进行peak calling。官网 ... great scarrier reef fancaps